ФГБУ ЦМИКЭЭ осуществляет деятельность по оказанию консультационных, учебно-методических услуг, проводит экспертную и научную деятельность. Проводит очно-заочные циклы обучения по программам: `Управление качеством в сфере здравоохранения`; `Экспертная деятельность в сфере непрерывного улучшения качества медицинской помощи`; Стандарты медицинской деятельности, Медицинские технологии;